第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會:KASP——快速高通量進行SNP分型的方法
來源: | 作者:sinogenomax | 發布時間: 1686天前 | 1442 次瀏覽 | 分享到:
2016年9月23日—9月25日,“第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會”(以下簡稱青科會)在亦莊舉辦。
2016年9月23日—9月25日,“第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會”(以下簡稱青科會)在亦莊舉辦。論壇內容分為腫瘤、細胞治療和分子醫學三部分,分別在三個分會場進行。
 


諾賽基因科技服務部婁海娟博士受邀參加第二屆青科會,向廣大學者介紹了一種快速高通量進行SNP分型的新方法——KASP。婁海娟博士從KASP簡介、KASP 分型原理、KASP應用范圍、案例解析這四個方面進行了詳細的介紹,引發了廣大聽眾的密切關注和激烈討論。


KASP平臺介紹

KASP方法即Kompetitive Allele-Specific PCR(競爭性等位基因特異性PCR),可以用2個熒光探針、2個通用淬滅探針,再加多個位點特異探針來檢則多個SNP位點,這項技術是基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels (Insertions and Deletions,插入和缺失)。原理上類似Taqman檢測,也是基于終端熒光讀取判斷,每孔采用雙色熒光檢測一個樣本的一個位點可能的兩種基因型,而KASP技術與Taqman技術不同的是,它不需要每個SNP位點都去合成特異的熒光引物,它基于自己獨特的ARM PCR原理,讓所有的位點檢測最終都使用通用熒光引物擴增,這大大降低了LGC KASP的試劑成本,既有金標準的準確,又降低了使用成本,比Taqman還具有更好的位點適應性,所以在醫學、農學檢測方面KASP都有非常好的應用。

技術特點

1.只要合成兩個通用熒光探針,兩個通用淬滅探針,再加合成多個針對具體位點的SNP PCR引物,就可以測許多位點。

2.因為熒光探針和淬滅探針相對較貴,KASP方法相比于Taqman方法,可以通過通用熒光探針來代替針對位點的熒光探針,大大節約成本。

送樣要求

1. 請提供血液、組織或DNA樣品,及準確的基因名稱(基因ID)、序列和詳細的SNP位點信息。

2. 血液:樣品需用EDTA抗凝,總量大于1 ml,采集后于-20℃或-80℃保存。

3. 組織:樣品可為新鮮組織(最好保存于-80℃)、石蠟包埋的組織或95%乙醇中固定的組織,總量≥10mg。樣品-70℃郵寄至本公司(干冰或液氮運送)以保證樣品質量。

4. 基因組DNA:濃度≥20ng/μl,總體積≥20μl。所需樣品量根據實驗要求做相應調整。

5. PCR產物:達到實驗要求的PCR產物,濃度≥50ng/μl,總體積≥20μl。

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